22 мая 1922 года на основе объединения сельскохозяйственного факультета Политехнического института и лесного факультета Казанского университета был учреждён Казанский институт сельского хозяйства и лесоводства. За прошедшие годы структура института неоднократно менялась. В разные периоды велась подготовка на зоотехническом факультете, плодоовощном, агролесомелиоративном.

В 1995 году Казанскому сельскохозяйственному институту как крупному учебно-научному центру в области подготовки специалистов для сельского хозяйства был присвоен статус академии. Дальнейшее стабильное и динамичное развитие академии, накопленный преподавательский и научный потенциал, позволяющий обеспечивать подготовку высококвалифицированных кадров для сельского хозяйства по широкому спектру специальностей, развитая научно-техническая база стали основанием для решения Аккредитационной Коллегии Федеральной службы по надзору в сфере образования и науки Министерства образования и науки Российской Федерации от 6 июля 2006 года (приказ от 27 июля 2006 г. №1868) о присвоении академии статуса университета. Новое название – Казанский государственный аграрный университет — было присвоено приказом учредителя вуза — Министерства сельского хозяйства Российской Федерации (приказ от 16 августа 2006 г. № 238)

В настоящее время Казанский государственный аграрный университет представляет собой крупный учебно-научный центр. В составе университета — Институт экономики, Институт механизации и технического сервиса и 2 факультета: агрономический и лесного хозяйства и экологии.